發布時間:2025-05-19 發布作者:上海通蔚生物
早期的PCR技術雖然具有突破性意義,但也存在一些局限性,促使科研人員不斷努力開發新的PCR酶和設備。本文主要圍繞酶發展史,介紹早期PCR存在的問題,以及克服這些問題的新型PCR酶的開發。
最初,DNA聚合酶I的Klenow片段用于在PCR中擴增DNA。然而,這種酶在高溫下不穩定,在PCR每次循環的熱變性步驟中失去活性。此外,延伸反應必須在低溫(+37°C)下進行。由于這些原因,早期的PCR存在以下問題并且不太方便:
對于實驗者來說非常繁瑣(每個循環添加Klenow酶是一項繁瑣且重復的任務)
昂貴(由于使用了大量Klenow酶)
存在非特異性擴增的可能性(在+37°C時,引物與DNA的非目標區域結合,擴增非特異性區域)
此外,該技術每次添加新的酶時都需要打開試管,容易受到污染;研究人員必須在整個反應過程中保持在場,這限制了他們一次可以處理的樣本數量;并且PCR過程無法輕易實現自動化。
解決上述問題需要很長時間的研究。在此過程中,新的PCR酶和設備正在開發中。下面我們就來看一下它的歷史。
科研人員對耐熱DNA聚合酶的分離和鑒定,使得通用PCR技術成為可能。TaqDNA聚合酶穩定,在PCR所用的高溫(約+72°C)延伸反應條件下表現出最佳活性。TaqDNA聚合酶在PCR重復循環過程中保持穩定,因此無需在每次循環后停止PCR并添加更多酶(Saiki等人,1988)。
從那時起,人們進行了各種改進,從而開發出更準確、更方便的PCR酶。
1989
DavidGelfand和SusanneStroffel(當時在Cetus公司,后來在羅氏分子診斷公司)于1986年純化了天然Taq酶。勃林格曼(現為羅氏)是供應重組Taq酶的公司之一。
然而,TaqDNA聚合酶仍有改進的空間。首先,該酶缺乏校對活性,無法糾正擴增過程中發生的轉錄錯誤(潛在突變)。在大多數擴增反應中,這些偶然發生的突變并不是什么大問題。然而,對于某些應用(例如擴增基因組DNA以進行測序或等位基因多態性研究),任何轉錄錯誤都可能導致錯誤的結果。
具有校對活性的耐熱DNA聚合酶的發布解決了這個問題,使得需要高度精確的轉錄反應的應用能夠實現高保真PCR。
1994
PwoDNA聚合酶是一種具有校對活性的耐熱酶,由勃林格曼公司(后來的羅氏公司)于1994年發布。
提高反應保真度的另一種方法是將TaqDNA聚合酶與耐熱酶(例如,TgoDNA聚合酶)或其他具有校對活性的蛋白質相結合。
1995
目前已有一款這樣的酶混合物——ExpandHighFidelityPCRSystem——上市。
使用酶混合物代替單一酶為PCR提供了重要的優勢,包括校對活性以及擴增更長靶標的能力(Barnes,1994)。
1996
經過進一步改進以優化反應,發布了用于擴增長達20kb的目標的酶混合物(擴展長模板PCR系統,于1994年推出)。隨后,一種新的酶混合物被發布,它能夠擴增長達35kb的目標(Expand20kbPLUSPCRSystem,于1996年推出)。
改良的TaqDNA聚合酶可實現“熱啟動PCR”,該PCR在室溫下不活躍,但在DNA變性溫度下容易被激活(Birch等人,1996年)。這將最大限度地減少麻煩的引物二聚體的形成。
2000年,FastStartTaqDNA聚合酶
作為“熱啟動PCR”應用產品推出(2000)。通過在其酶混合物(FastStart高保真PCR系統,于2003年推出)中添加FastStartTaqDNA聚合酶,羅氏創建了一個能夠滿足多重PCR和高保真熱啟動PCR等苛刻應用的系統。
以上我們介紹了PCR酶的發展和歷史。這樣發展起來的新型PCR技術現在不僅應用于基礎研究,還應用于醫療實踐、食品檢測和刑事調查等多個領域。